古墳時代に渡来した「第3の集団」：覚張隆史氏が語るゲノム解析と日本人のルーツ

日本人のルーツについて近年分かってきたこと。縄文人、その後に渡来の弥生人、2つの特徴を持った集団がいた、日本人の起源という風に考えられていました。

一方で古墳時代以降に新しい人たちが入ってきたというところが今回新しい発見。これが今回テーマにもなってる、謎の第3集団。

中央平原の集団と北東アジア集団の人たちが混血をしないで、それぞれ独自で入ってくるような、また新たな混血のパターンが見えてですね。弥生時代以前は巨大な墳墓というのは見つかっていなかった時期がありますので、そのタイミングで人が入ってきてる可能性があれば、前方後円墳に埋葬した人たちが大陸の集団と遺伝的に近いかもしれない。

こんにちは。PIVOTの磯です。今回のテーマは日本人のルーツの新仮説です。ゲストにお迎えしたのは金沢大学古代文明・文化資源学研究所准教授の覚張隆史さんです。よろしくお願いいたします。

よろしくお願いいたします。

覚張さんは分子生物学がご専門ということで、7月にこちら『日本人とは何か 私たちのルーツを巡る700万年の物語』をご出版なさいました。これまでも多くの古代人の人骨など調査なさってきたということですが、まず世界的に見て人類のルーツに関する研究って進んできているんでしょうか?

はい。もう新しいことがたくさん出てきてるので、本当にもういろんな論文が出てきて疲れちゃいますね。

特に遺跡を始めとする化石人骨がたくさん見つかってきているので、ホモ・サピエンスの誕生から、アウト・オブ・アフリカして、アフリカからユーラシアに拡散したという情報がたくさん出てくるっていうのも新しい発見ですけれども、1番大きな変化というのはやはり新しい技術が出てきて、各化石人骨から全DNA、ゲノムという情報を読み解くことができる。で、各時代でその遺伝的特徴が違うのかどうか、個体レベルで比較できるようになったという、そういった分析方法が出てきたのが、今、新しい人類研究につながってると思ってます。

だからそもそも分析対象になる人骨の数も増えている。で、その1つの人骨から分かる情報も圧倒的に増えているとすると、もう掛け合わせでどんどんいろんなことが分かってくる。

そうですね。15年ぐらい前ですかね。大体100ぐらいのDNAの配列しか読めなかった時代が長く続いてたんですけども、この20年から15年ぐらい前から、新しい技術で次世代シーケンサーという配列をたくさん読める装置が出てきてですね。

はい。

で、その装置があっても、なかなか古い人骨の分析に適用できるかっていったら難しかったんですけども、非常に断片化した古い人骨のDNA配列をつなぎ合わせて、最終的に約30億の配列を読めるような、そういう時代になってきたというのが、その基礎研究が長く続いたんですけども、今ようやく花開いてきてるという、そういう分野になっています。

あ、それが先ほどおっしゃっていた、もう忙しくてっていうところに繋がるわけですね。

そうですね。たくさん出ちゃいますからね。

新しいので色々分かってきたというのが、本の中にもお書きになってたと思うんですが、教えていただければと思います。大きく分けて2つテーマご用意しました。1つ目が「日本人のルーツに新仮説 古墳時代にやってきた謎の第3集団」。2つ目が「世界中で新発見が続々 明らかになる人類のルーツ」。まず早速1つ目のテーマから伺っていきたいんですが、日本人のルーツについて近年分かってきたこと、どんなことがあるんでしょうか?

はい。元々日本人は古い集団の縄文、その後に渡来系の弥生人というのが存在して、2つの特徴を持った集団がいたという、それが日本人の起源という風に考えられていました。

で、一方で新しく古墳時代以降に新しい人たちが入ってきたというところが、今回新しい発見になっていると思います。

これが今回テーマにもなってる、謎の第3集団と。

はい。特に長野県の飯田市にある口の塚古墳という非常に大きなお墓で、前方後円墳というお墓の中で埋葬されている男性の被葬者が、朝鮮半島の南部、今の金海ですね。その近郊にある大成洞古墳という、これも大きなお墓の中に被葬されている女性の人と非常に遺伝的に近いというのが分かってきて、直接的に血縁関係があったという、その可能性が分かってきたということです。

その長野と釜山の埋葬されてる方に血縁関係がありそうだというのが分かると、そういうルートで人が入ってきていたのかなっていうのが言えてくるという。

そうですね。はい。他の古墳時代の特徴とちょっと違っていて、そこでしか今ちょっと見えてないっていうようなルートがあったり、他の地点でもまた独自の人の移動のルートっていうのが見えてきてるというのが分かってきてます。

それいつ頃分かったんですか?

えっと、それが分かったのは本当にこの1年ぐらいの間ですね。

とってもホットな話ですね。それ分かった時って、その専門家の方々の間での受け入れられ方ってどうだったんでしょう?

まだ海外でしか発表していないので、これから日本でどういう風に捉えられるかちょっとまだ未知なんですけれども、海外の研究者では、そういう可能性は十分あってもおかしくないだろうというのは、はい、聞いておりますね。

ありがとうございます。また具体的にもお伺いしていきたいんですが、そもそも日本人はどこから来たのかっていうところから伺っていいですか?

はい。日本列島に入ってきたという大きな流れを考えていきますと、縄文時代以前の旧石器時代、石器が出てくるので、古いタイプの石器として旧石器時代という風に表現していますけども、日本列島で1番古い旧石器時代は3万8000年ぐらいから始まったという風に石器の特徴から言われています。

じゃあどういう風に入ってきたのか、色々な仮説があるんですが、北側のサハリンとか北海道の方から入ってくるようなルートや、大陸に比較的近いような朝鮮半島と九州のところの部分が近いですので、そこの方から入ってきたパターン、年代がちょっと新しくなるんですけれども、3万2000年頃から骨が琉球列島の方、南の方では見つかってますので、石器は少ないんですけども、おそらく非常に古い集団がいて、この3つの方向から入って来たんじゃないかという風に考えられています。

これ矢印の具合を見るに、北が主流っぽいというか、人口的には多かったということですか?

なかなかそれを評価するのは難しいんですが、石器の特徴からかなり北側からの影響が強いような考えを持ってる考古学の先生方もいらっしゃいますね。

なるほど。これが旧石器時代の流入ルート。

はい。可能性としてはそうですね。

はい。その後ってどうなっていくんでしょう?

この後に約1万6500年頃から、縄文時代の人たちが土器を作って、旧石器時代の人たちの後に存在していくわけです。

はい。

文化が違ってきますので、おそらく人の遺伝的な特徴が違う可能性もありますし、もしかしたら連続的に遺伝的に繋がってるという可能性もあります。それで縄文時代の人たちの遺伝的な特徴を調べることは、現代の日本人との関係性を考える上でも非常に重要だと思います。

はい。

ただ縄文時代より前の旧石器時代の人骨との比較も当然しなくては日本列島の全てのヒストリーを追えないんですけども、残念ながら人骨が本州や北海道、九州、四国はほぼ見つかってないというか、分析ができるレベルのものは見つかっていないんですね。

へえ。

一方で、琉球列島の方になってきますと、石灰岩地質帯が多いですので、人骨の残りが比較的良くてですね、3万年ぐらいに遡るような人骨のDNA分析も今、国立科学博物館の先生方、篠田先生が研究されていらっしゃいますので、そういったところのデータがこれから出ていくので、まだ分かっていないところではあります。

ああ、そっか。これ人骨が分析できるレベルで残るかどうかは、その時代の地質とかによる。

そうですね。大きく依存します。

ああ。で、これから、ちょっと分かってくるところもありそうだぞっていうのが。

はい。東京大学の先生方が、すでに琉球列島の港川遺跡という、世界的に見つかってる旧石器時代の人骨があるんですけども、一応DNAの分析は部分的にうまくいっておりまして、ミトコンドリアという細胞小器官のDNAの配列を分析して、縄文時代や現代の人たちとの比較解析というのは進めています。

うん。

その結果を見ると、どうやら直系の縄文人の祖先として言い切るにはちょっとまだ難しい。似ている配列はあるんで、大体似たようなグループの可能性はあるんですけども、直接の祖先というデータはまだ得られてないというところで、まだ謎に包まれています。

そうなんですね。

で、縄文時代、これ1番最初に私が論文を出した時に解析したものなんですけれども、左上側に縄文人という風に矢印で書いてあるところがあると思います。さらに左上の方に東アジア集団という風に書かれていて、これが中国とか朝鮮半島とか大陸の集団の遺伝的な特徴のポイントになります。

うん。

そこからやや離れているというのが分かります。で、右下に田園洞って読むんですが、中国の北部、北京の近くなんですけれども、4万年前の洞窟の人骨なんですね。

はい。

縄文人の人たちがややそちら側に寄っているような感じがする。古いタイプの遺伝的特徴を持ってる人が、どうやら縄文人の特徴なんじゃないかなっていうのが今分かってきています。

へえ。で、その後になるとどうでしょう?

縄文時代の後に弥生時代の渡来人の人たちが入ってくると。

はい。

現在色々な研究が、私だけではなくて、他の東京大学や国立科学博物館の先生方とも進められて、いくつかデータが得られています。どういう風な人の流れが来ているのか、いろんな地域で、九州の中でも西側とか、福岡の方とかですね、いろんなデータが徐々に出てきていて、それぞれの人骨の遺伝的特徴が結構違うっていうのが分かってきてですね。

へえ。

単純にわっと1回で来てるというよりも、地点ごとに大陸のところから違うパターンで人が入ってきてるような、ちょっと不思議な挙動を示してるのが弥生時代の特徴のように感じます。

地点ごとにちょっと特徴が違いそうだぞっていうのが分かるぐらい、ちゃんと人骨もこの時点で残っているっていうこと。なんとなく素人目線で言っても、このエリアの人って大体顔立ちがはっきりした人が多いよねっていうエリアと、そうじゃないエリアみたいなイメージはある方多いかなって思うんですけど、その流入したタイミングとかで違う人たちが入ってきているっていうのは。

はい。そうですね。地点ごとに違うんですが、全体的には大陸の中でも北側ですね、朝鮮半島の北部から中国の北東部、でさらに上まで行くとバイカル湖って、ロシアの方の湖があると思うんですが、そちらの方で遺伝的に違う集団がいてですね、北東アジア集団という風に私たちの研究分野ではよく言うんですけども、その北側の集団の影響が結構強いんですね。

ただそれだけでは全部説明できなくて、それがちょっと南側、南と言っても中国のやっぱり北部の内陸の方の遺伝的特徴を持ってるような人たちもいたりですね、結構複雑で地点ごとに違ったりするので、何か統一的に弥生人が誰かっていう風に言えないっていうのが、多分今の正確な表現になっていくのかなと思います。

なんとなく教科書では縄文人、弥生人みたいに言いますけど、一口に縄文人、弥生人と言っても、その中に色々あるよというのが、考えてみたらそりゃそうですよね、っていうのが色々分かってきているというところで、これ以外のところで第3の集団が分かってきたという。

はい。で、古墳時代になりますけれども、同様に様々な地域で北東アジア集団、もしくは先ほど言ったその中国の内陸というか、私は専門でセントラルプレインっていう平原があるんですけれども、中央平原という風に日本語で直訳すると表現できます。で、その中央平原の集団と北東アジア集団の人たちが混血をしないで、それぞれ独自で入ってくるような、また新たな混血のパターンが見えてですね。

え、それって混血して入ってきたか、混血しないで入ってきたかって、今解析した時に違いが見えるものなんですか?

基本的には平均的な遺伝的特徴を比較するような解析、ちょっと難しい表現で主成分分析なんですけども、それだと分かりません。

はい。うん。

なんでかというと、大陸の中で遺伝的に違うというものが分かっていて、その突然変異というのが蓄積されて区別ができるようになって、それで比較解析ができるわけですよね。

はい。はい。

で、元々弥生時代にその混ざってしまったものが日本列島に入ってしまうと、同じ供給元、遺伝的に同じようなところから、また時代が後になる古墳時代に入ってきても、なかなかその識別が困難だと多分思います。

はい。はい。

で、ただですね、弥生時代に北東アジアの集団と中央平原の集団が入っているんですけれども、その人たちが待ち構えてるけれども、その人たちの特徴が反映されないで、例えば中央平原だけの特徴がいきなり日本列島に入ってきて、北東アジア集団の影響がないようなものも見つかってきているんですね。ということは、待ち構えてる集団の人たちと交わらないで、違うところで人が入ってきて入植して、混血したという、そういうストーリーが見えてきているんですね。

え、そのぐらいの精度でちゃんと分かるもの?

そうですね。それも色々解析ができるようになった、直接できるようになったから、こういうのが分かっているというとこですね。

あ、面白い。じゃ、謎の第3集団というのは、それら全てをひっくるめての第3集団という。

そうですね。これが第3集団っていうふわっとしてる表現っていうのが、そこが重要で。

ああ。

全てを私まだ分析できてない、捉えられていないですけども、分析をしている数というのはそこまで多くないにもかかわらず、先ほど言った朝鮮半島の人と個人的というか血縁関係がある可能性が非常に高いというのが分かってきてますので、十数個体分析しただけでもそういうのが見つかってきていると。で、古墳時代っていうのは大体300年ほどですよね。

はい。

血縁解析を色々たくさんしていくと、大体100年ぐらいか150年ぐらいで血縁度というのが近い人が見つかれば、すぐに、あ、ここから来たんだっていう風に直接分かるんですよね。だからゲノムの平均的な特徴を知らなくても、血縁関係を皮切りにして研究をするということが、ゲノム解析でできるようになってきたという。

そういう第3集団があったというのが濃厚っていうのが去年ぐらいに分かったっていう話だったと思うんですけれども、じゃあどんどん解析進めていったら、本当に今後数年とかのうちに、より詳しい情報も見えてくるかなという。

はい。十分ありえます。

面白いですね。

特に今、韓国の方や中国の方で大量に人骨の出土が確認されていて、同時代でも人骨のゲノム解析での研究っていうのが進んでいて、彼らとも色々と相互に情報交換しながら科学的な解析を進めていくという、そういう感じですね。

うん。これ、その謎の第3集団、どんな集団だと考えられるんですかね?

はい。古墳時代は弥生時代と違って、まず前半期に非常に大きな前方後円墳が出てきます。で、弥生時代ではそれ以前はそこまで大きな巨大な墳墓というのが見つかっていなかった時期がありますので、それを在地の弥生時代に渡来してきた人たちが全てを作ったのか、もしくは新たな大陸の集団が関与していったのか、それがちょっとまだ分からないというところがあります。

そのタイミングで人が入ってきてる可能性があれば、前方後円墳に埋葬した人たちが大陸の集団と遺伝的に近いかもしれないと。

うん。

今回長野県の飯田市の古墳から出てきてるものも前方後円墳ですので、そういった方が大陸と非常に近いというのは、もしかしたら前方後円墳の被葬者の多くが大陸の集団とも遺伝的に近い可能性っていうのはあるんですけども、残念ながらまだ非常に多くある前方後円墳のほんの一握りしかゲノム解析というのは進んでいませんので、ただそれでも見つかってしまってるっていうのは、非常に興味深いところであります。

前方後円墳の被葬者だとすると、可能性段階とはいえ、第3集団はエリート集団みたいな感じだった可能性がある。

はい。その可能性はあります。

おお。

はい。で、合わせて他の地域の古墳時代の庶民層って言ったら、ちょっと適切かわかんないですけども、前方後円墳クラスではなくて、ちょっとお墓のタイプが違う横穴墓という、岩壁に少し穴を開けて、それで埋葬するという、そういうタイプの方々も、その方々と遺伝的に違うかどうかっていうのをちょっと今検討しているところで、ちょっと違うところもありますし、ただ先ほど述べたように、前方後円墳の埋葬されてる人骨というのはほとんど分析されていませんので、そのデータを増やすことによって、その検証がすぐできるという風に感じています。

本の中でも技術者集団みたいな表現もありましたよね。

はい。エリート層だけではなくて、新しい文化を持ってきた人たちが古墳時代に確実にいると私は思っています。

はい。

特に、お墓から出土する須恵器という、非常に高温で焼成して焼いた、硬質の硬い土器が出てきますし、それは今まで弥生時代ではなかったような技術です。

うん。

あとは馬の飼育をする集団というのが入ってくるというのが考古遺物からも分かっていて、馬をコントロールするためのハミという馬具があると思うんですけども、それも大陸において非常に似たような特徴を持ってるのが近年分かってきてますので、そういったものが実際に物だけ送られてきているのか、人も一緒に入ってきてるのか、このゲノムデータを基準にして調べることで、その違い、文化が伝播してるのか、人が実際来てるのかを実証できる、そういう時代になってきたということですね。

いや、あと第3集団の規模感、人口が多かったのか少なかったのかって。

はい。それはまだですね、データが少ないですけども、ゲノムデータが分かると、遺伝的多様性で人口の規模感っていうのは計算はできます。

おお。

今計算中なので、乞うご期待というところで。

はい。

色々お伺いしてきたんですが、この図ってどう見たらいいですか?

こちらは現代日本人や現代の大陸の集団、あと先住民の方々と言われてるアイヌの方々や、縄文の人たちの遺伝的特徴を地点ごとに落としているような、そういうもので、点が近いと遺伝的に近いというものなんです。

はい。

左下にアイヌという風に書いてますが、この縦長に少しまとまってるような集団がアイヌの方々です。

あ、アイヌの方々結構広いんですね。

そうですね。一方で、その左下のところに1点だけポンといます。これ私が1番最初に研究チームで全ゲノム読んだ縄文人のゲノムの地点ですね。

うん。

アイヌの方々と比較的近いというのが分かります。

はい。

一方で現代日本人や大陸の人じゃかなり離れていて、遺伝的に違うのは分かるんですけども、現代日本人は1番上の大陸の人たちよりも若干縄文寄りに行ってるとですよね。

そうですね。へえ。

はい。なので大陸の方々とちょっと違う、縄文的な様子も残ってるというのが、この図から読み解けるわけです。

こう見ると、やっぱり日本人って特徴あるというか、固有の。

そうですね。

あるんですね。

やっぱりここの、なんて言うんですか、縦長の部分のところが日本人の構造というか、全体を括れるような、そういうなんとなく繋がってるように見えますよね。これは歴史が存在して、それがゲノムデータでも見えるという、そういうのを可視化させてるというものになっています。

面白いです。だからこの古代の人がどうだったのかを知ることは、本当に現代日本人を解析する上でも役立つっていうのは、これ見ても改めて実感が湧きました。

今後は、今その縄文時代の人から現代日本人、大陸っていう風になってますけども、現代日本人と現代の大陸の、ほとんど違いがないような、その小さなわずかな部分で、弥生時代や古墳時代の人たちが行ったり来たりしてる可能性があるんで、そこの部分をたくさんデータを集めていくと、どういう時にどういう風に移動してるかっていうのが、まるで動画のように見えてくるっていう、そういう時代も出てくると思うんで、まずはデータをたくさん増やしていく必要があるということです。

はい。

データ増えてってほしいなと思いますね、これ。ありがとうございます。世界的に見て、人類のルーツについての注目されてる研究があれば伺いたい。

ヨーロッパの方で大体5万年に遡るような非常に古い人骨が出てきてます。ホモ・サピエンスの特徴は明確に持っているんですが、現代の私たちに繋がらない途絶えた系統があったというのが分かってきたりしてます。

アウト・オブ・アフリカ。ここに関して今分かっていること。

昔の話だと6万年とかぐらいに外に出てったんじゃないかっていう話がありましたけど、洞窟がですね、そういうのが東南アジアで7万年近い年代が出てきているというのがありますので、実在していただろうというのが分かってきたと。

今後ここ注目すると面白いよ、みたいなことがもしあれば教えていただきたいな。

例えば感染症がどういう風に日本列島に入ってきたのか。そういう研究も人骨の分析からできるようになってきています。細菌やウイルスのゲノムの配列も読めたりしています。人の移動とウイルスや細菌の移動みたいなものが見えると、病原菌やウイルスと人類がどう戦ってきたのかというヒストリーが見えてですね。

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